Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Actn1Q7TPR4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Actn1Q7TPR4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms