Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNS8

Epop, Elongin BC and Polycomb repressive complex 2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpopQ7TNS8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EpopQ7TNS8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EpopQ7TNS8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EpopQ7TNS8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EpopQ7TNS8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EpopQ7TNS8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EpopQ7TNS8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EpopQ7TNS8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EpopQ7TNS8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EpopQ7TNS8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EpopQ7TNS8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EpopQ7TNS8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EpopQ7TNS8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EpopQ7TNS8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EpopQ7TNS8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EpopQ7TNS8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EpopQ7TNS8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EpopQ7TNS8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EpopQ7TNS8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EpopQ7TNS8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EpopQ7TNS8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EpopQ7TNS8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EpopQ7TNS8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EpopQ7TNS8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EpopQ7TNS8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EpopQ7TNS8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EpopQ7TNS8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EpopQ7TNS8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EpopQ7TNS8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EpopQ7TNS8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EpopQ7TNS8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EpopQ7TNS8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EpopQ7TNS8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms