Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smap2Q7TN29 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smap2Q7TN29 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smap2Q7TN29 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smap2Q7TN29 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smap2Q7TN29 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smap2Q7TN29 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smap2Q7TN29 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smap2Q7TN29 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smap2Q7TN29 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smap2Q7TN29 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smap2Q7TN29 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smap2Q7TN29 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smap2Q7TN29 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smap2Q7TN29 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smap2Q7TN29 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smap2Q7TN29 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smap2Q7TN29 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smap2Q7TN29 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Smap2Q7TN29 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Smap2Q7TN29 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smap2Q7TN29 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Smap2Q7TN29 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smap2Q7TN29 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smap2Q7TN29 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smap2Q7TN29 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smap2Q7TN29 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smap2Q7TN29 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smap2Q7TN29 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smap2Q7TN29 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smap2Q7TN29 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smap2Q7TN29 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smap2Q7TN29 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smap2Q7TN29 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smap2Q7TN29 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms