Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mindy1Q76LS9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms