Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQA6

Igsf3, Immunoglobulin superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf3Q6ZQA6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Igsf3Q6ZQA6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Igsf3Q6ZQA6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Igsf3Q6ZQA6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Igsf3Q6ZQA6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igsf3Q6ZQA6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igsf3Q6ZQA6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igsf3Q6ZQA6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igsf3Q6ZQA6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igsf3Q6ZQA6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igsf3Q6ZQA6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igsf3Q6ZQA6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igsf3Q6ZQA6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igsf3Q6ZQA6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igsf3Q6ZQA6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igsf3Q6ZQA6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igsf3Q6ZQA6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igsf3Q6ZQA6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igsf3Q6ZQA6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igsf3Q6ZQA6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igsf3Q6ZQA6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igsf3Q6ZQA6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igsf3Q6ZQA6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igsf3Q6ZQA6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igsf3Q6ZQA6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igsf3Q6ZQA6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igsf3Q6ZQA6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igsf3Q6ZQA6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igsf3Q6ZQA6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igsf3Q6ZQA6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms