Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms