Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn5Q6VZZ7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn5Q6VZZ7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms