Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ift172Q6VH22 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ift172Q6VH22 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ift172Q6VH22 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ift172Q6VH22 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ift172Q6VH22 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ift172Q6VH22 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ift172Q6VH22 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ift172Q6VH22 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ift172Q6VH22 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ift172Q6VH22 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ift172Q6VH22 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ift172Q6VH22 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ift172Q6VH22 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ift172Q6VH22 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ift172Q6VH22 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ift172Q6VH22 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ift172Q6VH22 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ift172Q6VH22 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ift172Q6VH22 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ift172Q6VH22 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ift172Q6VH22 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ift172Q6VH22 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ift172Q6VH22 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Ift172Q6VH22 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ift172Q6VH22 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ift172Q6VH22 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ift172Q6VH22 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ift172Q6VH22 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms