Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIC6

Atp1a3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a3Q6PIC6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp1a3Q6PIC6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms