Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHQ9

Pabpc4, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4Q6PHQ9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pabpc4Q6PHQ9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pabpc4Q6PHQ9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pabpc4Q6PHQ9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pabpc4Q6PHQ9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms