Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad54bQ6PFE3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad54bQ6PFE3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175.3 ms