Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gramd2bQ6PEM6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gramd2bQ6PEM6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gramd2bQ6PEM6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gramd2bQ6PEM6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gramd2bQ6PEM6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gramd2bQ6PEM6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gramd2bQ6PEM6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gramd2bQ6PEM6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gramd2bQ6PEM6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gramd2bQ6PEM6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gramd2bQ6PEM6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gramd2bQ6PEM6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gramd2bQ6PEM6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gramd2bQ6PEM6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gramd2bQ6PEM6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gramd2bQ6PEM6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gramd2bQ6PEM6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gramd2bQ6PEM6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gramd2bQ6PEM6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gramd2bQ6PEM6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gramd2bQ6PEM6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gramd2bQ6PEM6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gramd2bQ6PEM6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gramd2bQ6PEM6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gramd2bQ6PEM6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gramd2bQ6PEM6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gramd2bQ6PEM6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gramd2bQ6PEM6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gramd2bQ6PEM6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gramd2bQ6PEM6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gramd2bQ6PEM6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gramd2bQ6PEM6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gramd2bQ6PEM6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gramd2bQ6PEM6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gramd2bQ6PEM6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gramd2bQ6PEM6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Gramd2bQ6PEM6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gramd2bQ6PEM6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Gramd2bQ6PEM6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gramd2bQ6PEM6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gramd2bQ6PEM6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gramd2bQ6PEM6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gramd2bQ6PEM6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms