Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc85bQ6PDY0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc85bQ6PDY0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms