Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dtx4Q6PDK8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms