Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rundc3bQ6PDC0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms