Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim37Q6PCX9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim37Q6PCX9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim37Q6PCX9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim37Q6PCX9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim37Q6PCX9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim37Q6PCX9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim37Q6PCX9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim37Q6PCX9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim37Q6PCX9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim37Q6PCX9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim37Q6PCX9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim37Q6PCX9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim37Q6PCX9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim37Q6PCX9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim37Q6PCX9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim37Q6PCX9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim37Q6PCX9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim37Q6PCX9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim37Q6PCX9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim37Q6PCX9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim37Q6PCX9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trim37Q6PCX9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms