Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prkab2Q6PAM0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prkab2Q6PAM0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prkab2Q6PAM0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prkab2Q6PAM0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prkab2Q6PAM0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prkab2Q6PAM0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prkab2Q6PAM0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prkab2Q6PAM0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prkab2Q6PAM0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prkab2Q6PAM0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prkab2Q6PAM0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prkab2Q6PAM0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prkab2Q6PAM0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prkab2Q6PAM0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Prkab2Q6PAM0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prkab2Q6PAM0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prkab2Q6PAM0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prkab2Q6PAM0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prkab2Q6PAM0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prkab2Q6PAM0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prkab2Q6PAM0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Prkab2Q6PAM0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prkab2Q6PAM0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prkab2Q6PAM0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prkab2Q6PAM0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prkab2Q6PAM0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prkab2Q6PAM0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prkab2Q6PAM0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Prkab2Q6PAM0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prkab2Q6PAM0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prkab2Q6PAM0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Prkab2Q6PAM0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prkab2Q6PAM0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prkab2Q6PAM0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prkab2Q6PAM0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prkab2Q6PAM0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prkab2Q6PAM0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prkab2Q6PAM0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prkab2Q6PAM0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms