Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAJ1

Bcr, Breakpoint cluster region protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcrQ6PAJ1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BcrQ6PAJ1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BcrQ6PAJ1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BcrQ6PAJ1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BcrQ6PAJ1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BcrQ6PAJ1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BcrQ6PAJ1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms