Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S0

Mtss1l, MTSS1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtss1lQ6P9S0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mtss1lQ6P9S0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mtss1lQ6P9S0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mtss1lQ6P9S0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mtss1lQ6P9S0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mtss1lQ6P9S0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mtss1lQ6P9S0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mtss1lQ6P9S0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Mtss1lQ6P9S0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtss1lQ6P9S0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtss1lQ6P9S0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtss1lQ6P9S0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtss1lQ6P9S0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtss1lQ6P9S0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtss1lQ6P9S0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtss1lQ6P9S0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtss1lQ6P9S0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtss1lQ6P9S0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mtss1lQ6P9S0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mtss1lQ6P9S0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mtss1lQ6P9S0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Mtss1lQ6P9S0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mtss1lQ6P9S0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mtss1lQ6P9S0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mtss1lQ6P9S0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mtss1lQ6P9S0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mtss1lQ6P9S0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mtss1lQ6P9S0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtss1lQ6P9S0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtss1lQ6P9S0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtss1lQ6P9S0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtss1lQ6P9S0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtss1lQ6P9S0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtss1lQ6P9S0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtss1lQ6P9S0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtss1lQ6P9S0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtss1lQ6P9S0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtss1lQ6P9S0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms