Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam222bQ6P539 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam222bQ6P539 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam222bQ6P539 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam222bQ6P539 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam222bQ6P539 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam222bQ6P539 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam222bQ6P539 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam222bQ6P539 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam222bQ6P539 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam222bQ6P539 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam222bQ6P539 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam222bQ6P539 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam222bQ6P539 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam222bQ6P539 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Fam222bQ6P539 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam222bQ6P539 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam222bQ6P539 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam222bQ6P539 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam222bQ6P539 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam222bQ6P539 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam222bQ6P539 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam222bQ6P539 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam222bQ6P539 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam222bQ6P539 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam222bQ6P539 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam222bQ6P539 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam222bQ6P539 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam222bQ6P539 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam222bQ6P539 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam222bQ6P539 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam222bQ6P539 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam222bQ6P539 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam222bQ6P539 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam222bQ6P539 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam222bQ6P539 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam222bQ6P539 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam222bQ6P539 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms