Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4S6

Sik3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik3Q6P4S6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sik3Q6P4S6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sik3Q6P4S6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sik3Q6P4S6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sik3Q6P4S6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms