Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec23ipQ6NZC7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sec23ipQ6NZC7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec23ipQ6NZC7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec23ipQ6NZC7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec23ipQ6NZC7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec23ipQ6NZC7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec23ipQ6NZC7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec23ipQ6NZC7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec23ipQ6NZC7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec23ipQ6NZC7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec23ipQ6NZC7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec23ipQ6NZC7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec23ipQ6NZC7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec23ipQ6NZC7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec23ipQ6NZC7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec23ipQ6NZC7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec23ipQ6NZC7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec23ipQ6NZC7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec23ipQ6NZC7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec23ipQ6NZC7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms