Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE3

Spin2c, Spindlin-2C, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spin2cQ6NVE3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spin2cQ6NVE3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spin2cQ6NVE3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spin2cQ6NVE3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spin2cQ6NVE3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Spin2cQ6NVE3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spin2cQ6NVE3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spin2cQ6NVE3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spin2cQ6NVE3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spin2cQ6NVE3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spin2cQ6NVE3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spin2cQ6NVE3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spin2cQ6NVE3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Spin2cQ6NVE3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spin2cQ6NVE3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spin2cQ6NVE3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spin2cQ6NVE3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Spin2cQ6NVE3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spin2cQ6NVE3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spin2cQ6NVE3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spin2cQ6NVE3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spin2cQ6NVE3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spin2cQ6NVE3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spin2cQ6NVE3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spin2cQ6NVE3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spin2cQ6NVE3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms