Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ7

Ltv1, Protein LTV1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltv1Q6NSQ7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ltv1Q6NSQ7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ltv1Q6NSQ7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ltv1Q6NSQ7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ltv1Q6NSQ7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ltv1Q6NSQ7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ltv1Q6NSQ7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ltv1Q6NSQ7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ltv1Q6NSQ7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ltv1Q6NSQ7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ltv1Q6NSQ7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ltv1Q6NSQ7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ltv1Q6NSQ7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ltv1Q6NSQ7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ltv1Q6NSQ7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ltv1Q6NSQ7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ltv1Q6NSQ7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ltv1Q6NSQ7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ltv1Q6NSQ7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ltv1Q6NSQ7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ltv1Q6NSQ7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ltv1Q6NSQ7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ltv1Q6NSQ7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ltv1Q6NSQ7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ltv1Q6NSQ7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ltv1Q6NSQ7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ltv1Q6NSQ7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ltv1Q6NSQ7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ltv1Q6NSQ7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ltv1Q6NSQ7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ltv1Q6NSQ7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ltv1Q6NSQ7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ltv1Q6NSQ7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ltv1Q6NSQ7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ltv1Q6NSQ7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ltv1Q6NSQ7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ltv1Q6NSQ7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ltv1Q6NSQ7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ltv1Q6NSQ7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ltv1Q6NSQ7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ltv1Q6NSQ7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ltv1Q6NSQ7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ltv1Q6NSQ7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms