Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU0

UPF0524 protein C3orf70 homolog, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6GQU0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q6GQU0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q6GQU0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q6GQU0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q6GQU0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q6GQU0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q6GQU0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q6GQU0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q6GQU0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q6GQU0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q6GQU0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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