Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC6

Tro, Tro protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,087 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TroQ6DIC6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TroQ6DIC6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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