Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nop58Q6DFW4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nop58Q6DFW4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nop58Q6DFW4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nop58Q6DFW4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nop58Q6DFW4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nop58Q6DFW4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nop58Q6DFW4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nop58Q6DFW4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nop58Q6DFW4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nop58Q6DFW4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nop58Q6DFW4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nop58Q6DFW4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nop58Q6DFW4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nop58Q6DFW4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nop58Q6DFW4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nop58Q6DFW4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nop58Q6DFW4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nop58Q6DFW4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nop58Q6DFW4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nop58Q6DFW4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Nop58Q6DFW4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nop58Q6DFW4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nop58Q6DFW4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nop58Q6DFW4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nop58Q6DFW4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nop58Q6DFW4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Nop58Q6DFW4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nop58Q6DFW4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nop58Q6DFW4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nop58Q6DFW4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nop58Q6DFW4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nop58Q6DFW4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nop58Q6DFW4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nop58Q6DFW4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nop58Q6DFW4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nop58Q6DFW4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nop58Q6DFW4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nop58Q6DFW4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nop58Q6DFW4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nop58Q6DFW4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nop58Q6DFW4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nop58Q6DFW4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nop58Q6DFW4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nop58Q6DFW4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nop58Q6DFW4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nop58Q6DFW4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nop58Q6DFW4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nop58Q6DFW4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nop58Q6DFW4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nop58Q6DFW4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Nop58Q6DFW4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nop58Q6DFW4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nop58Q6DFW4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nop58Q6DFW4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nop58Q6DFW4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nop58Q6DFW4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nop58Q6DFW4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nop58Q6DFW4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nop58Q6DFW4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nop58Q6DFW4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nop58Q6DFW4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nop58Q6DFW4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nop58Q6DFW4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nop58Q6DFW4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nop58Q6DFW4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nop58Q6DFW4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nop58Q6DFW4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nop58Q6DFW4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nop58Q6DFW4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nop58Q6DFW4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nop58Q6DFW4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nop58Q6DFW4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Nop58Q6DFW4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nop58Q6DFW4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nop58Q6DFW4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nop58Q6DFW4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nop58Q6DFW4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nop58Q6DFW4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nop58Q6DFW4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Nop58Q6DFW4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Nop58Q6DFW4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nop58Q6DFW4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nop58Q6DFW4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nop58Q6DFW4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nop58Q6DFW4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nop58Q6DFW4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nop58Q6DFW4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nop58Q6DFW4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nop58Q6DFW4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nop58Q6DFW4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nop58Q6DFW4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nop58Q6DFW4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nop58Q6DFW4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nop58Q6DFW4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nop58Q6DFW4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nop58Q6DFW4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nop58Q6DFW4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nop58Q6DFW4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nop58Q6DFW4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms