Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp7Q6A4J8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp7Q6A4J8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms