Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt12Q64291 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms