Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col4a5Q63ZW6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col4a5Q63ZW6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col4a5Q63ZW6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms