Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpd52Q62393 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpd52Q62393 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpd52Q62393 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpd52Q62393 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpd52Q62393 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpd52Q62393 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpd52Q62393 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpd52Q62393 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpd52Q62393 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpd52Q62393 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpd52Q62393 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpd52Q62393 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpd52Q62393 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpd52Q62393 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpd52Q62393 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpd52Q62393 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpd52Q62393 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpd52Q62393 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpd52Q62393 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpd52Q62393 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpd52Q62393 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpd52Q62393 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpd52Q62393 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpd52Q62393 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpd52Q62393 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpd52Q62393 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpd52Q62393 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpd52Q62393 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpd52Q62393 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpd52Q62393 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpd52Q62393 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpd52Q62393 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpd52Q62393 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpd52Q62393 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpd52Q62393 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpd52Q62393 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tpd52Q62393 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms