Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn9aQ62205 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scn9aQ62205 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scn9aQ62205 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scn9aQ62205 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scn9aQ62205 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scn9aQ62205 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scn9aQ62205 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn9aQ62205 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn9aQ62205 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn9aQ62205 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn9aQ62205 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn9aQ62205 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scn9aQ62205 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scn9aQ62205 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scn9aQ62205 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scn9aQ62205 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scn9aQ62205 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Scn9aQ62205 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Scn9aQ62205 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scn9aQ62205 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scn9aQ62205 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scn9aQ62205 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scn9aQ62205 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scn9aQ62205 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Scn9aQ62205 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scn9aQ62205 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scn9aQ62205 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scn9aQ62205 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Scn9aQ62205 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Scn9aQ62205 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Scn9aQ62205 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Scn9aQ62205 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms