Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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Trim27Q62158 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim27Q62158 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
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