Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BcanQ61361 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BcanQ61361 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BcanQ61361 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
BcanQ61361 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BcanQ61361 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BcanQ61361 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BcanQ61361 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BcanQ61361 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BcanQ61361 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BcanQ61361 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BcanQ61361 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BcanQ61361 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BcanQ61361 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BcanQ61361 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BcanQ61361 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BcanQ61361 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BcanQ61361 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BcanQ61361 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BcanQ61361 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BcanQ61361 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BcanQ61361 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BcanQ61361 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BcanQ61361 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BcanQ61361 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BcanQ61361 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BcanQ61361 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BcanQ61361 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BcanQ61361 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BcanQ61361 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BcanQ61361 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BcanQ61361 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BcanQ61361 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BcanQ61361 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BcanQ61361 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BcanQ61361 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BcanQ61361 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BcanQ61361 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BcanQ61361 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BcanQ61361 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BcanQ61361 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BcanQ61361 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BcanQ61361 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BcanQ61361 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BcanQ61361 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BcanQ61361 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
BcanQ61361 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
BcanQ61361 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BcanQ61361 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BcanQ61361 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BcanQ61361 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BcanQ61361 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BcanQ61361 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BcanQ61361 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BcanQ61361 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BcanQ61361 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BcanQ61361 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BcanQ61361 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BcanQ61361 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BcanQ61361 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BcanQ61361 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BcanQ61361 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BcanQ61361 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BcanQ61361 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BcanQ61361 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BcanQ61361 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BcanQ61361 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BcanQ61361 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BcanQ61361 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BcanQ61361 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BcanQ61361 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BcanQ61361 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BcanQ61361 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BcanQ61361 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BcanQ61361 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BcanQ61361 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BcanQ61361 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BcanQ61361 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BcanQ61361 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BcanQ61361 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BcanQ61361 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BcanQ61361 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BcanQ61361 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BcanQ61361 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BcanQ61361 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BcanQ61361 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
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