Protein–RNA interactions for Protein: Q61146

Ocln, Occludin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OclnQ61146 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OclnQ61146 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OclnQ61146 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OclnQ61146 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OclnQ61146 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OclnQ61146 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OclnQ61146 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OclnQ61146 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OclnQ61146 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OclnQ61146 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OclnQ61146 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OclnQ61146 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OclnQ61146 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OclnQ61146 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OclnQ61146 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OclnQ61146 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OclnQ61146 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OclnQ61146 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OclnQ61146 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OclnQ61146 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OclnQ61146 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OclnQ61146 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OclnQ61146 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OclnQ61146 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OclnQ61146 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
OclnQ61146 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OclnQ61146 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OclnQ61146 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OclnQ61146 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OclnQ61146 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OclnQ61146 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OclnQ61146 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OclnQ61146 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OclnQ61146 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OclnQ61146 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OclnQ61146 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OclnQ61146 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OclnQ61146 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
OclnQ61146 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OclnQ61146 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OclnQ61146 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OclnQ61146 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OclnQ61146 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms