Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lamb3Q61087 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lamb3Q61087 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms