Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ift20Q61025 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ift20Q61025 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ift20Q61025 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ift20Q61025 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ift20Q61025 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ift20Q61025 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ift20Q61025 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ift20Q61025 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ift20Q61025 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ift20Q61025 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ift20Q61025 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms