Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Neurod1Q60867 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Neurod1Q60867 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Neurod1Q60867 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Neurod1Q60867 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Neurod1Q60867 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Neurod1Q60867 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Neurod1Q60867 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Neurod1Q60867 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Neurod1Q60867 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Neurod1Q60867 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Neurod1Q60867 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Neurod1Q60867 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Neurod1Q60867 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Neurod1Q60867 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Neurod1Q60867 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Neurod1Q60867 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Neurod1Q60867 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Neurod1Q60867 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Neurod1Q60867 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Neurod1Q60867 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Neurod1Q60867 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Neurod1Q60867 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Neurod1Q60867 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Neurod1Q60867 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Neurod1Q60867 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Neurod1Q60867 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Neurod1Q60867 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Neurod1Q60867 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Neurod1Q60867 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Neurod1Q60867 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Neurod1Q60867 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Neurod1Q60867 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Neurod1Q60867 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Neurod1Q60867 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Neurod1Q60867 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Neurod1Q60867 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Neurod1Q60867 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Neurod1Q60867 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Neurod1Q60867 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Neurod1Q60867 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Neurod1Q60867 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Neurod1Q60867 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Neurod1Q60867 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Neurod1Q60867 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Neurod1Q60867 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Neurod1Q60867 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Neurod1Q60867 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Neurod1Q60867 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Neurod1Q60867 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Neurod1Q60867 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Neurod1Q60867 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Neurod1Q60867 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Neurod1Q60867 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Neurod1Q60867 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Neurod1Q60867 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Neurod1Q60867 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Neurod1Q60867 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Neurod1Q60867 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Neurod1Q60867 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Neurod1Q60867 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms