Protein–RNA interactions for Protein: Q5YD48

A1cf, APOBEC1 complementation factor, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1cfQ5YD48 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
A1cfQ5YD48 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
A1cfQ5YD48 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A1cfQ5YD48 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A1cfQ5YD48 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A1cfQ5YD48 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A1cfQ5YD48 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A1cfQ5YD48 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A1cfQ5YD48 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A1cfQ5YD48 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A1cfQ5YD48 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A1cfQ5YD48 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A1cfQ5YD48 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A1cfQ5YD48 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A1cfQ5YD48 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A1cfQ5YD48 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A1cfQ5YD48 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A1cfQ5YD48 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms