Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Rabl6Q5U3K5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rabl6Q5U3K5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rabl6Q5U3K5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rabl6Q5U3K5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rabl6Q5U3K5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rabl6Q5U3K5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rabl6Q5U3K5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rabl6Q5U3K5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rabl6Q5U3K5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rabl6Q5U3K5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rabl6Q5U3K5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rabl6Q5U3K5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rabl6Q5U3K5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rabl6Q5U3K5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rabl6Q5U3K5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rabl6Q5U3K5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rabl6Q5U3K5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rabl6Q5U3K5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rabl6Q5U3K5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rabl6Q5U3K5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rabl6Q5U3K5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rabl6Q5U3K5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rabl6Q5U3K5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rabl6Q5U3K5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rabl6Q5U3K5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rabl6Q5U3K5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rabl6Q5U3K5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rabl6Q5U3K5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rabl6Q5U3K5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rabl6Q5U3K5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rabl6Q5U3K5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rabl6Q5U3K5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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