Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Specc1Q5SXY1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Specc1Q5SXY1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Specc1Q5SXY1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Specc1Q5SXY1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Specc1Q5SXY1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Specc1Q5SXY1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Specc1Q5SXY1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Specc1Q5SXY1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Specc1Q5SXY1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Specc1Q5SXY1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Specc1Q5SXY1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Specc1Q5SXY1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Specc1Q5SXY1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Specc1Q5SXY1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Specc1Q5SXY1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Specc1Q5SXY1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Specc1Q5SXY1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Specc1Q5SXY1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Specc1Q5SXY1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Specc1Q5SXY1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Specc1Q5SXY1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Specc1Q5SXY1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Specc1Q5SXY1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Specc1Q5SXY1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Specc1Q5SXY1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Specc1Q5SXY1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Specc1Q5SXY1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Specc1Q5SXY1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Specc1Q5SXY1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Specc1Q5SXY1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Specc1Q5SXY1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Specc1Q5SXY1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Specc1Q5SXY1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Specc1Q5SXY1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Specc1Q5SXY1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Specc1Q5SXY1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Specc1Q5SXY1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Specc1Q5SXY1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Specc1Q5SXY1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Specc1Q5SXY1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms