Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sco1Q5SUC9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sco1Q5SUC9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sco1Q5SUC9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sco1Q5SUC9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sco1Q5SUC9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sco1Q5SUC9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sco1Q5SUC9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sco1Q5SUC9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sco1Q5SUC9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Sco1Q5SUC9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sco1Q5SUC9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sco1Q5SUC9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sco1Q5SUC9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sco1Q5SUC9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sco1Q5SUC9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sco1Q5SUC9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sco1Q5SUC9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sco1Q5SUC9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sco1Q5SUC9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sco1Q5SUC9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sco1Q5SUC9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sco1Q5SUC9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sco1Q5SUC9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sco1Q5SUC9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sco1Q5SUC9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Sco1Q5SUC9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sco1Q5SUC9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sco1Q5SUC9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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Sco1Q5SUC9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Sco1Q5SUC9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sco1Q5SUC9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sco1Q5SUC9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sco1Q5SUC9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sco1Q5SUC9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sco1Q5SUC9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sco1Q5SUC9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sco1Q5SUC9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Sco1Q5SUC9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sco1Q5SUC9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sco1Q5SUC9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sco1Q5SUC9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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Sco1Q5SUC9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sco1Q5SUC9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sco1Q5SUC9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sco1Q5SUC9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sco1Q5SUC9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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Sco1Q5SUC9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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Sco1Q5SUC9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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Sco1Q5SUC9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sco1Q5SUC9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sco1Q5SUC9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sco1Q5SUC9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sco1Q5SUC9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sco1Q5SUC9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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Sco1Q5SUC9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sco1Q5SUC9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sco1Q5SUC9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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Sco1Q5SUC9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Sco1Q5SUC9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sco1Q5SUC9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sco1Q5SUC9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sco1Q5SUC9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sco1Q5SUC9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sco1Q5SUC9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sco1Q5SUC9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sco1Q5SUC9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sco1Q5SUC9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sco1Q5SUC9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sco1Q5SUC9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sco1Q5SUC9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sco1Q5SUC9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sco1Q5SUC9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sco1Q5SUC9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sco1Q5SUC9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sco1Q5SUC9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sco1Q5SUC9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sco1Q5SUC9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sco1Q5SUC9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sco1Q5SUC9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sco1Q5SUC9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sco1Q5SUC9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sco1Q5SUC9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 184 ms