Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH7

Zzef1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzef1Q5SSH7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zzef1Q5SSH7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zzef1Q5SSH7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zzef1Q5SSH7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zzef1Q5SSH7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zzef1Q5SSH7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zzef1Q5SSH7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Zzef1Q5SSH7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zzef1Q5SSH7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zzef1Q5SSH7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zzef1Q5SSH7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zzef1Q5SSH7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zzef1Q5SSH7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zzef1Q5SSH7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zzef1Q5SSH7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zzef1Q5SSH7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zzef1Q5SSH7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zzef1Q5SSH7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Zzef1Q5SSH7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Zzef1Q5SSH7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zzef1Q5SSH7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zzef1Q5SSH7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zzef1Q5SSH7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms