Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS91

Sun3, SUN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sun3Q5SS91 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sun3Q5SS91 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sun3Q5SS91 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sun3Q5SS91 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sun3Q5SS91 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sun3Q5SS91 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sun3Q5SS91 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sun3Q5SS91 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sun3Q5SS91 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sun3Q5SS91 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sun3Q5SS91 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sun3Q5SS91 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sun3Q5SS91 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sun3Q5SS91 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sun3Q5SS91 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sun3Q5SS91 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sun3Q5SS91 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sun3Q5SS91 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sun3Q5SS91 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sun3Q5SS91 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sun3Q5SS91 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sun3Q5SS91 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sun3Q5SS91 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sun3Q5SS91 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sun3Q5SS91 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sun3Q5SS91 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sun3Q5SS91 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sun3Q5SS91 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sun3Q5SS91 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sun3Q5SS91 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sun3Q5SS91 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sun3Q5SS91 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sun3Q5SS91 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sun3Q5SS91 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sun3Q5SS91 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sun3Q5SS91 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sun3Q5SS91 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sun3Q5SS91 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sun3Q5SS91 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sun3Q5SS91 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sun3Q5SS91 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sun3Q5SS91 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sun3Q5SS91 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sun3Q5SS91 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sun3Q5SS91 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sun3Q5SS91 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sun3Q5SS91 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sun3Q5SS91 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sun3Q5SS91 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sun3Q5SS91 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms