Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Vps54Q5SPW0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vps54Q5SPW0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms