Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1C3

Trav3-3, T cell receptor alpha variable 3-3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav3-3Q5R1C3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trav3-3Q5R1C3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav3-3Q5R1C3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav3-3Q5R1C3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav3-3Q5R1C3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav3-3Q5R1C3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trav3-3Q5R1C3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav3-3Q5R1C3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trav3-3Q5R1C3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav3-3Q5R1C3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms