Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms