Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2f8Q58FA4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2f8Q58FA4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2f8Q58FA4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2f8Q58FA4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
E2f8Q58FA4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2f8Q58FA4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
E2f8Q58FA4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2f8Q58FA4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2f8Q58FA4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2f8Q58FA4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2f8Q58FA4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2f8Q58FA4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2f8Q58FA4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2f8Q58FA4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2f8Q58FA4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2f8Q58FA4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2f8Q58FA4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2f8Q58FA4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2f8Q58FA4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2f8Q58FA4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms