Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZGD9

Nxf3, Nuclear RNA export factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxf3Q4ZGD9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nxf3Q4ZGD9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nxf3Q4ZGD9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms