Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA53

Pds5b, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pds5bQ4VA53 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Pds5bQ4VA53 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
Pds5bQ4VA53 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Pds5bQ4VA53 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Pds5bQ4VA53 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Pds5bQ4VA53 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Pds5bQ4VA53 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Pds5bQ4VA53 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Pds5bQ4VA53 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Pds5bQ4VA53 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Pds5bQ4VA53 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Pds5bQ4VA53 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Pds5bQ4VA53 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Pds5bQ4VA53 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Pds5bQ4VA53 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Pds5bQ4VA53 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Pds5bQ4VA53 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Pds5bQ4VA53 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Pds5bQ4VA53 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Pds5bQ4VA53 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Pds5bQ4VA53 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Pds5bQ4VA53 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
Pds5bQ4VA53 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Pds5bQ4VA53 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Pds5bQ4VA53 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Pds5bQ4VA53 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Pds5bQ4VA53 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Pds5bQ4VA53 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Pds5bQ4VA53 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Pds5bQ4VA53 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Pds5bQ4VA53 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Pds5bQ4VA53 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Pds5bQ4VA53 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Pds5bQ4VA53 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Pds5bQ4VA53 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Pds5bQ4VA53 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Pds5bQ4VA53 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Pds5bQ4VA53 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Pds5bQ4VA53 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Pds5bQ4VA53 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Pds5bQ4VA53 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Pds5bQ4VA53 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Pds5bQ4VA53 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Pds5bQ4VA53 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Pds5bQ4VA53 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Pds5bQ4VA53 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Pds5bQ4VA53 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Pds5bQ4VA53 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Pds5bQ4VA53 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Pds5bQ4VA53 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Pds5bQ4VA53 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Pds5bQ4VA53 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Pds5bQ4VA53 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Pds5bQ4VA53 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Pds5bQ4VA53 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Pds5bQ4VA53 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Pds5bQ4VA53 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Pds5bQ4VA53 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Pds5bQ4VA53 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Pds5bQ4VA53 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Pds5bQ4VA53 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Pds5bQ4VA53 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Pds5bQ4VA53 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Pds5bQ4VA53 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Pds5bQ4VA53 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Pds5bQ4VA53 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Pds5bQ4VA53 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Pds5bQ4VA53 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Pds5bQ4VA53 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Pds5bQ4VA53 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Pds5bQ4VA53 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Pds5bQ4VA53 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Pds5bQ4VA53 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Pds5bQ4VA53 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Pds5bQ4VA53 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Pds5bQ4VA53 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Pds5bQ4VA53 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Pds5bQ4VA53 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Pds5bQ4VA53 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Pds5bQ4VA53 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Pds5bQ4VA53 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Pds5bQ4VA53 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Pds5bQ4VA53 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Pds5bQ4VA53 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Pds5bQ4VA53 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Pds5bQ4VA53 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Pds5bQ4VA53 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Pds5bQ4VA53 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Pds5bQ4VA53 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Pds5bQ4VA53 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Pds5bQ4VA53 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Pds5bQ4VA53 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Pds5bQ4VA53 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Pds5bQ4VA53 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Pds5bQ4VA53 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Pds5bQ4VA53 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Pds5bQ4VA53 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Pds5bQ4VA53 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Pds5bQ4VA53 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Pds5bQ4VA53 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms